Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PNKPQ96T60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNKPQ96T60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms