Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SIN3AQ96ST3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SIN3AQ96ST3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SIN3AQ96ST3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms