Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A1Q96NT5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A1Q96NT5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A1Q96NT5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms