Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP57Q96MR6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP57Q96MR6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms