Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf48Q96LS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf48Q96LS8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf48Q96LS8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2orf48Q96LS8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2orf48Q96LS8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2orf48Q96LS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2orf48Q96LS8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms