Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS50Q96JG6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS50Q96JG6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms