Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED30Q96HR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED30Q96HR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms