Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A3Q96HJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A3Q96HJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms