Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHFRQ96EP1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHFRQ96EP1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms