Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM19Q96E16 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM19Q96E16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms