Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAF2Q96CS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAF2Q96CS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms