Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLCD1Q96CP7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLCD1Q96CP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms