Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC74AQ96AQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC74AQ96AQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC74AQ96AQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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