Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAVIN3Q969G5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAVIN3Q969G5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAVIN3Q969G5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms