Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX1Q92786 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PROX1Q92786 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PROX1Q92786 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms