Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX19Q92543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX19Q92543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX19Q92543 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms