Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNKSR2Q8WXI2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNKSR2Q8WXI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms