Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC110Q8TBZ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC110Q8TBZ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC110Q8TBZ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms