Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM58Q8NG06 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM58Q8NG06 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms