Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF397Q8NF99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF397Q8NF99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF397Q8NF99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms