Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CATSPER1Q8NEC5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms