Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FSIP1Q8NA03 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms