Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALM2Q8IXS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2Q8IXS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2Q8IXS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms