Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHERPQ8IWX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHERPQ8IWX8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms