Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC103Q8IW40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC103Q8IW40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms