Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSTM4Q8IW00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSTM4Q8IW00 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms