Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC50Q8IVM0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC50Q8IVM0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC50Q8IVM0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms