Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRLF3Q8IUI8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms