Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC190Q86UF4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC190Q86UF4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms