Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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