Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPUQ71F23 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPUQ71F23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPUQ71F23 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms