Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC55Q6ZSA7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC55Q6ZSA7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms