Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SARM1Q6SZW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SARM1Q6SZW1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms