Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP4Q6PIL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP4Q6PIL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms