Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCN12Q6JVE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN12Q6JVE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN12Q6JVE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms