Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPRIN2Q6IMN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPRIN2Q6IMN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPRIN2Q6IMN6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms