Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPECC1LQ69YQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPECC1LQ69YQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms