Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RNF123Q5XPI4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RNF123Q5XPI4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RNF123Q5XPI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms