Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECM29Q5VYK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms