Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AGAP6Q5VW22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
AGAP6Q5VW22 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms