Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP9Q5VTM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms