Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRAMEF5Q5TYX0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms