Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIN9Q5TKA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN9Q5TKA1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms