Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNYL2Q5T2Q4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNYL2Q5T2Q4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms