Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATAD3CQ5T2N8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATAD3CQ5T2N8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms