Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1orf220Q5T0J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms