Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCID2Q5JVF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCID2Q5JVF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms