Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CEP78Q5JTW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP78Q5JTW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP78Q5JTW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms