Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC4Q5GLZ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms