Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ODF2Q5BJF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODF2Q5BJF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODF2Q5BJF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms